Molecular Motors Manipulation Lab

SCIENTIFIC AREA
Nanobiotechnology
CENTER
Instituto Madrileño de Estudios Avanzados en Nanociencia (IMDEA-Nanociencia)
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borja.ibarra@gmail.com
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Mitochondrial DNA replication dynamics

We offer the possibility to conduct the TFM at the 'Molecular Motors Manipulation Lab' at IMDEA Nanociencia (UAM).

The objective of this work will be to characterize, at the single molecule level, the dynamics and mechanical properties that govern the operation of the mitochondrial DNA polymerase, PolG. This protein is responsible for the accurate replication of the mitochondrial genome, and therefore, it is essential for cell survival.

The TFM student will use biochemical and state-of-the-art single molecule techniques, optical tweezers, to measure and to manipulate mechanically the activity of single PolG molecules.

These studies will reveal the molecular mechanism used by this protein to move along the DNA and to interact with the DNA replication fork.

 

Dinámica de replicación del genoma mitocondrial

Se oferta la posibilidad de realizar el trabajo de fin de master en el laboratorio de ‘Nano-manipulación de Motores Moleculares Biológicos’ del IMDEA Nanociencia, situado en el campus de la UAM.

El trabajo consistirá en estudiar los procesos dinámicos y mecánicos que gobiernan a nivel molecular la actividad de la proteína PolG; la ADN polimerasa mitocondrial. Esta proteína es esencial para la correcta replicación del ADN mitocondrial y es por tanto, esencial para la supervivencia celular.

El candidato utilizará técnicas bioquímicas y técnicas biofísicas de última generación, como las pinzas ópticas, para seguir en tiempo real y manipular mecánicamente la actividad de moléculas individuales de PolG. De esta manera se estudiarán los mecanismos moleculares utilizados por esta proteína para desplazarse a lo largo del ADN e interaccionar con la horquilla de replicación.

mitochondria

 

MASTER
Biomolecules & Cell D.
Molecular Biomedicine
Biotechnology